La colección del museo comprende 3.500 fósiles, principalmente del cantón del Jura, de los cuales casi 400 se exponen en las vitrinas. Para cada grupo, los fósiles se comparan con especies actuales relacionadas. El museo está rodeado por el Jardín Botánico, el Arboreto y los invernaderos donde se conservan antiguas variedades de fruta de Ajoie. Es posible apuntarse a visitas temáticas como la de Dinotec o la de las excavaciones de Banné. Las exposiciones permanentes permiten ver de cerca la fauna del Jura.
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