Hace 3.700 años, lo que entonces era una bahía poco profunda del lago Victoria se convirtió en el lago Nabugabo tras la formación de un lido de arena que lo aisló. Hoy en día, separada del gran lago por 4 km de limo, arena y pantano, esta masa de agua de casi 25 km2 se distingue de su imponente vecino por la composición físico-química de sus aguas y por su ictiofauna (sus peces, si lo prefiere...). Los nadadores estarán encantados de saber que, debido a la falta de calcio (necesario para la generación de conchas de moluscos) en cantidades suficientes, los huéspedes intermedios de los gusanos responsables de la bilharzia están ausentes. Por lo tanto, la natación es, a priori, segura. Los ictiólogos profesionales y aficionados deberían incluir el lago Nabugabo y todo su sistema lacustre en su programa. De hecho, la desunión del lago Victoria y su pequeño golfo ha "secuestrado" varias especies de peces de agua dulce en lo que se ha convertido en el lago Nabugabo. Estas últimas, separadas de sus congéneres, siguen existiendo en el sistema lacustre del lago Nabugabo, mientras que desaparecieron totalmente (o casi) del lago Victoria tras la introducción de la perca del Nilo en la década de 1950. Aunque también están amenazados, en el sistema lacustre del lago Nabugabo y en las pequeñas masas de agua circundantes (Kayanja, Kayugi y Manywa) le esperan ocho especies de cíclidos (cinco de ellas endémicas) y un buen ejemplo de especiación. El lago, rodeado -al norte, al este y al sur- por el vasto pantano de Lwamunda, tiene también un gran interés botánico, ya que se han catalogado no menos de 300 especies de plantas, entre ellas dos endémicas y varias insectívoras (droseráceas). Situado, además, en un corredor migratorio, el sistema lacustre acoge, en determinadas épocas del año, a más del 15% de la población mundial de golondrinas azules. Además de las especies vulnerables, las orillas del lago son frecuentadas por una plétora de aves (colibríes, tejedores, rollos de violeta, touracos, águilas...). Los expatriados aficionados al triatlón y al duatlón pueden participar en las competiciones que organiza una vez al año (en febrero o marzo) el equipo de triatlón Nabugabo (www.nabugabotriathlon.com).

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